RAPD技術(shù)的全稱是隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA(Random Amplified Polymorphic DNA)，此技術(shù)建立于PCR基礎(chǔ)之上，使用一系列具有10個(gè)左右堿基的單鏈隨機(jī)引物，對(duì)基因組的DNA全部進(jìn)行PCR擴(kuò)增，以檢測(cè)多態(tài)性。由于整個(gè)基因組存在眾多反向重復(fù)序列，因此須對(duì)每一隨機(jī)引物單獨(dú)進(jìn)行PCR，單一引物與反向重復(fù)序列結(jié)合，使重復(fù)序列之間的區(qū)域得以擴(kuò)增。引物結(jié)合位點(diǎn)DNA序列的改變以及兩擴(kuò)增位點(diǎn)之間DNA堿基的缺失、插入或置換均可導(dǎo)致擴(kuò)增片段數(shù)目和長度的差異，經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分離后通過EB染色以檢測(cè)DNA的片段的多態(tài)性。